中国女医师协会是由全国女医务工作者自愿组成的专业性、非营利性的社会法人社团，也是由卫生部主管并依法在民政部注册的国家一级协会，旨在依法维护女医务工作者的权益，团结全国广大女医务工作者，积极投身于现代化建设，加强医学学术研究，提高女医务工作者的业务和学术水平，促进交流与合作，加强队伍建设，为提高人类健康水平，为建设有中国特色的社会主义强国做贡献。 本会遵守国家宪法、法律、法规和国家政策，遵守社会道德风尚。
中国女医师协会设有眼科、妇产科、临床肿瘤学、心血管、公共卫生、卫生发展与管理、儿科、皮肤病、整形美容、医学影像、康复医学会、中医、病理学、肾脏病及血液净化、全科医学、医院建设管理、神经内科学、临床呼吸、健康教育、疼痛、药学、医疗信息化、糖尿病医学、心身医学与临床心理学、视光学、抗衰老医学、肛肠、精准微创医疗、检验医学29个专业委员会。