南京市博物馆位于南京市中心新街口的朝天宫，朝天宫是江南地区现存规模最大、建筑等级最高、保存最为完好的一组明清官式古建筑群。其建筑格局、样式、营造技术等，是研究中国古代建筑尤其是明清建筑的重要而难得的实物资料，具有极高的历史、艺术和科学价值。
南京市博物馆有十万件文物收藏，其藏品上溯远古，下迄民国，内涵非常丰富。南京市博物馆根据馆藏文物的特点，定位于展示古都南京历史文化上，结合历史文献，以《六朝风采》、《明都南京》两个展示作为南京古都历史文化的基本陈列，其中《六朝风采》被评为"全国首届十大精品陈列"。 在馆藏文物中，南京人头骨化石、青釉羽人纹盘口壶、青瓷莲花尊、王、谢家族墓志、青花萧何追韩信梅瓶、镶金托云龙纹玉带、渔翁戏荷琥珀杯等，是各个历史时期的文物精粹的典型代表。馆藏文物多次远涉重洋，在美国、德国、英国、日本、韩国、新加坡等国展出，引起各地观众的极大兴趣，向世界展示了中国古代传统文化的精彩。